"מכון ירושלים" אשר נוסד בירושלים לפני קרוב לשלושים שנה, נחשב כיום לגדול מכוני המחקר התורניים. עם רשת שלוחות במקומות שונים בארץ ובחו"ל, המקיפות את מיטב הכוחות התורניים. אשר הביאו לתנופה מרשימה בגדלה ובהיקפה של היצירה התורנית. "מכון ירושלים" מעסיק צוות גדול של תלמידי חכמים וחוקרים, המונה למעלה ממאה ועשרים איש. במסגרות השונות של המכון הופיעו עד היום כ-500 ספרים.


זכה נכון ירושלים ומפעליו מאז היווסדו לברכתם ועידודם של גדולי מאורי הדור, אשר עמדו בראש ובנשיאות, האצילו מרוחם והודם, כיוונו הדרך והאירו הנתיב. כנשיאי המכון כיהנו מרנן ורבנן הגר"י הוטנר, הגרש"ז אויערבאך, הגר"ב זולטי, הגר"א גולדשמיט זכר צדיקים לברכה. ויבלחטו"א מרנן הגר"ע יוסף המכהן גם כנשיא מכון אור המזרח, והגר"י קוליץ שליט"א.


מרכז ה"מכון" נמצא בבית "מכון ירושלים", ברחוב גלעד ברובע היהודי בעיר העתיקה של ירושלים, בית עתיק בעל עבר היסטורי מפואר שנבנה על ידי הברון רוטשילד מפרנקפורט, ונמסר ע"י בעלי הבית חברת פקידים ואמרכלים מהולנד (פקו"ם) ל"מכון ירושלים". כיום שוכנים בשני אגפי הבנין משרדי ההנהלה, ספריה תורנית מרכזית, מפעל"אוצר מפרשי התלמוד", ובית מדרש "זרע יצחק" על שמו ולזכרו של ראש המכון הגאון רבי יצחק הוטנר זצ"ל, בתי הדפוס ומשרדי ההוצאה לאור.


• הכוונה והדרכת בוגרי הישיבות לאפיקי מחקר ויצירה תורניים.

• הוצאותם לאור של יצירות תורניות וגאולתם של כתבי יד נדירים ראשונים במעלה, המשמשים את ציבור תופשי התורה, ומהווים נכס רב ערך לעם ישראל.

• יסוד והקמתם של בתי מדרש לתלמידי חכמים וחוקרים בשלוחות שונות ברחבי הארץ והעולם.